Heritavia · Заметки

Сырой файл: откуда скачать и как загрузить на GEDmatch

На GEDmatch нужен исходный файл генотипирования. PDF, этнический отчёт и скриншот сайт не сравнивает.

Серия. Обзор · 1. Файл · 2. Профиль · 3. Проекты · 4. Совпадения

Вам нужен raw DNA file, то есть исходный файл генотипирования. Именно его GEDmatch умеет сравнивать с другими людьми.

Не PDF с результатами.

Не отчёт об этническом происхождении.

Не скриншот из личного кабинета.

Не медицинский отчёт.

Компания, где вы сдавали тест, отдаёт этот файл отдельно. Пока на компьютере лежит только красивый отчёт, загружать на GEDmatch ещё нечего.

Откуда его скачивать

Путь в кабинете у каждой компании свой, но везде это один и тот же тип файла: текст с генотипами, а не рассказ о процентах.

AncestryDNA. В аккаунте: DNA → Your DNA Results Summary → Settings → Download DNA Data. Ссылка из письма живёт недолго, поэтому скачивайте файл сразу. В архиве лежит текст. На GEDmatch загружайте его, не сопроводительный отчёт. У GEDmatch есть своя инструкция для AncestryDNA.

23andMe. Обычно: Settings → 23andMe Data → Download Raw Data. Файл готовят не сразу. Ссылка приходит на почту, иногда через несколько часов. Пока письма нет, это не ошибка загрузки на GEDmatch: файла ещё просто нет у вас.

MyHeritage. DNA → Manage DNA kits → меню нужного набора → Download raw DNA data. Инструкция GEDmatch для MyHeritage.

FamilyTreeDNA. Для обычной аутосомной генеалогии нужен Family Finder. Y-DNA и митохондриальный тест — другие типы исследования. Они не заменяют аутосомный набор и как обычный файл для matching не подойдут. Как GEDmatch описывает загрузку Family Finder.

Living DNA. Сырой файл скачивается из аккаунта компании и затем загружается на GEDmatch. Отдельная страница GEDmatch.

Генотек, Атлас и другие клинические панели GEDmatch обычно не принимает. Чип и формат там другие. Конвертировать такой файл вручную не стоит: сравнение получится мусором, а выглядеть будет как настоящий набор.

Никогда не открывайте raw DNA в Excel

Raw DNA — структурированный текстовый файл. В нём столбцы, строки и заголовок, которые сайт читает как есть.

Не нужно открывать его в Excel, сортировать, менять колонки, удалять «лишние» строки и сохранять заново в надежде починить формат. Таблица портит столбцы. После этого загрузка падает, часто без понятной ошибки, и кажется, что сломался GEDmatch.

Если задача — загрузить DNA, используйте оригинальный файл, который вы скачали у компании.

Один человек — один kit

Если вы уже загрузили свой файл AncestryDNA, не нужно загружать его ещё раз только потому, что тот же файл лежит у вас на MyHeritage или FamilyTreeDNA. Это всё тот же человек и тот же DNA-профиль.

AncestryDNA
    ↓
raw DNA
    ↓
GEDmatch
    ↓
один kit

Второй набор того же человека совпадает сам с собой почти полностью. В проекте это выглядит как близнец, хотя никакого второго родственника нет.

Другое дело, если тест сдавали разные члены семьи. У каждого тогда свой kit, и это как раз очень полезно.

ваш kit
    +
kit отца
    +
kit матери
    +
kit двоюродного родственника

Такой набор позволяет понять, с какой стороны семьи пришёл конкретный match. Одно совпадение «со мной» ещё ничего не говорит о ветви. Совпадение со мной и с отцом уже относит человека к отцовской стороне.

Когда DNA-наборов становится несколько, заведите отдельную таблицу. Иначе через полгода номера перепутаются, и в проект уйдёт не тот kit.

KitЧеловекТестЛинияРегионProjects
AB1234567выAncestryDNAотецМинщинаBelarus
CD7654321отецMyHeritageотецПуховичиBelarus

Номера в таблице — образец того, как они выглядят. Это не живые наборы.

Чей файл можно загружать

Это место, на котором чаще всего ошибаются из лучших побуждений.

GEDmatch прямо указывает, чей DNA можно загружать: свой; человека, для которого вы законный опекун; человека, который дал вам конкретное разрешение; человека, который вам известен как умерший; в отдельных условиях — DNA с предмета, принадлежавшего умершему. Подробности — в политике конфиденциальности.

Поэтому файл родственника не стоит загружать просто потому, что «это мой отец, я ведь и так веду его генеалогию». Для живого человека нужно разрешение именно на GEDmatch. Набор ребёнка не загружают «заодно».

Аккаунт, номер и ожидание

Зарегистрируйтесь на gedmatch.com. Базовая работа бесплатная. Код подтверждения почты часто падает в спам. Почта должна быть та, которую вы действительно читаете: её видят совпадения и администратор проекта. Ящик, который вы открываете раз в год, заявку хоронит так же надёжно, как закрытый kit.

После загрузки набору присваивается Kit Number. Сейчас это обычно две случайные буквы и семь цифр, например AB1234567. Сохраните его. По новым номерам нельзя понять компанию теста. У старых наборов первая буква ещё что-то значила: A — Ancestry, M — 23andMe, T — FTDNA, H — MyHeritage. На новые это не распространяется. Компанию всё равно укажите в профиле: по ней люди ищут ваше дерево на исходном сайте.

Официальная инструкция говорит, что после загрузки полная обработка всех функций может занять до 24 часов. Поэтому нет matches через несколько минут — это не ошибка. Подождите. В проект имеет смысл вступать, когда набор уже обработан: до этого администратор не увидит вас в сравнениях, и заявка будет пустой.

Повторно не заливайте файл «потому что совпадений нет». Сутки — нормальный срок. Если загрузка оборвалась, удалите сломанный набор в управлении kit и загрузите исходный файл ещё раз. Два полуготовых набора сами не склеятся.

Дальше набор нужно подписать так, чтобы с ним можно было работать: профиль, видимость и дерево.

Вся серия Все записи Заказать стратегию